「分子動力学AFM像シミュレータ」では、探針を試料に近づけることによる試料分子の変形を考慮したシミュレーションが可能です。原子一つ一つについてニュートンの運動方程式を解くことにより、分子構造の時間変化を求めることが出来ます。

フォースカーブ測定モード
あるxy位置で探針を試料に近づけ、探針に作用する力を計算します。
高さ一定モード
探針を高さ一定で平面上を走査し、探針に作用する力を計算します。
高さ一定・ノンコンタクトモード
探針を振動させながら高さ一定で平面上を走査し、周波数シフトを計算します。
緩和計算
シミュレーションの前準備として試料分子の構造の緩和計算を行います。