GeoAFM 高速相互予測AFMシミュレータ

  Advanced Simulator for the Scanning Probe Microscopy  
   
GeoAFM 高速相互予測AFMシミュレータ
http://www.aasri.jp/pub/spm/pdf/about_GeoAFM.pdf
SPMSimulatorガイドブック(GeoAFM)
http://www.aasri.jp/pub/spm/pdf/SPM_guidebook_Geo.pdf

GeoAFM 使用例
http://www.aasri.jp/pub/spm/pdf/user_report_geo_1.pdf
http://www.aasri.jp/pub/spm/pdf/user_report_geo_2.pdf

「高速相互予測AFMシミュレータ」では以下の三つのモードが用意されています。
探針形状データ、試料表面形状データから、測定AFM像データを求めるモード
探針形状データ、測定AFM像データから、試料表面形状データを求めるモード
試料表面形状データ、測定AFM像データから、探針形状データを求めるモード

GeoAFMシミュレータ実行動画
探針形状データ、試料表面形状データから、測定AFM像データを求めるモード
・ピラミッド型探針を使用した、HOPG(HighlyOriented Pyrolytic Graphite:高配向熱分解黒鉛)上に配置されたラクトン系高分子量ポリマー(CLG:εカプロラクトン・(L)ラクチド・グリコリド共重合体)のAFM像を、シミュレーションによって求めたものです。
    「設定項目の入力、および、計算の様子」
    計算手順書(Excel)
    設定・出力ファイル(Zip)

・先端が二股になっている不完全な探針を使って、HOPG(HighlyOriented Pyrolytic Graphite:高配向熱分解黒鉛)上に配置されたラクトン系高分子量ポリマー(CLG:εカプロラクトン・(L)ラクチド・グリコリド共重合体)のAFM像をシミュレーションによって求めたものです。
    「設定項目の入力、および、計算の様子」
    計算手順書(Excel)
    設定・出力ファイル(Zip)

・Cone型探針を使って、GroEL(シャペロニン)のAFM像をシミュレーションによって求めたものです。(シャペロニンは、縦140[Å]、横140[Å]、高さ200[Å]の籠のような形をした高分子です。AFM画像によって、籠の上部の穴を再現します。)
    「設定項目の入力、および、計算の様子」
    計算手順書(Excel)
    設定・出力ファイル(Zip)

・先端が二股になっている不完全な探針を使って、GroEL(シャペロニン)のAFM像をシミュレーションによって求めたものです。(シャペロニンは、縦140[Å]、横140[Å]、高さ200[Å]の籠のような形をした高分子です。AFM画像によって、籠の上部の穴を再現します。)
    「設定項目の入力、および、計算の様子」
    計算手順書(Excel)
    設定・出力ファイル(Zip)

・ピラミッド型探針を使用した、Si(111)-(7×7)DAS構造のAFM像を、シミュレーションによって求めたものです。
    「設定項目の入力、および、計算の様子」
    計算手順書(Excel)
    設定・出力ファイル(Zip)

探針形状データ、測定AFM像データから、試料表面形状データを求めるモード
・先端が二股になっている不完全な探針を使って得られた、HOPG(HighlyOriented Pyrolytic Graphite:高配向熱分解黒鉛)上に配置されたラクトン系高分子量ポリマー(CLG:εカプロラクトン・(L)ラクチド・グリコリド共重合体)のAFM像から、アーティファクトを除去した試料画像をシミュレーションによって求めたものです。
    「設定項目の入力、および、計算の様子」
    計算手順書(Excel)
    設定・出力ファイル(Zip)

試料表面形状データ、測定AFM像データから、探針形状データを求めるモード
・先端が二股になっている不完全な探針を使って得られた、HOPG(HighlyOriented Pyrolytic Graphite:高配向熱分解黒鉛)上に配置されたラクトン系高分子量ポリマー(CLG:εカプロラクトン・(L)ラクチド・グリコリド共重合体)のAFM像、および、分子構造データから得られる試料画像データから、探針形状画像をシミュレーションによって求めたものです。
    「設定項目の入力、および、計算の様子」
    計算手順書(Excel)
    設定・出力ファイル(Zip)

・先端が二股になっている不完全な探針を使って得られた、GroEL(シャペロニン)のAFM像、および、分子構造データから得られる試料画像データから、探針形状画像をシミュレーションによって求めたものです。(シャペロニンは、縦140[Å]、横140[Å]、高さ200[Å]の籠のような形をした高分子です。)
    「設定項目の入力、および、計算の様子」
    計算手順書(Excel)
    設定・出力ファイル(Zip)

・Si(111)-(7×7)DAS構造のAFM像、および、結晶原子構造データから得られる試料画像データから、探針形状画像をシミュレーションによって求めたものです。
    「設定項目の入力、および、計算の様子」
    計算手順書(Excel)
    設定・出力ファイル(Zip)